細(xì)胞STR分型介紹
細(xì)胞STR分型(cell line STR genotyping)也稱為短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)分型、簡單重復(fù)序列(SSR)分型或微衛(wèi)星標(biāo)記(Microsatellite)分型,是檢測廣泛分布在真核生物基因組中的簡單重復(fù)序列。一般由2-6bp的核心序列串聯(lián)重復(fù)而成,構(gòu)成了STR基因座的遺傳多態(tài)性。對于一個特定的個體,染色體上某個特定位置的重復(fù)序列的重復(fù)次數(shù)是固定的,而對于不同的個體重復(fù)次數(shù)可能不同,這就構(gòu)成了人群中STR的多態(tài)性。由于人類基因組中這種重復(fù)序列非常多,通過對STR多態(tài)性的檢測,就可以區(qū)分個體之間的差異,確定親緣關(guān)系。
STR/SSR具有分布廣泛均勻、多態(tài)性豐富、遵循孟德爾共顯性遺傳、信息量大、檢測簡便等優(yōu)點(diǎn),STR/SSR分型快捷,結(jié)果準(zhǔn)確,是非常重要的遺傳標(biāo)記,在遺傳制圖、連鎖性分析、親子鑒定、疾病基因定位和物種多態(tài)性研究等領(lǐng)域有著廣泛的應(yīng)用。
微衛(wèi)星位點(diǎn)通常通過PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物通過電泳分析檢測。ABI3730XL遺傳分析儀對熒光標(biāo)記DNA segments進(jìn)行檢測,加上分子量內(nèi)標(biāo)進(jìn)行DNA片段長度計(jì)算,使STR分型變得快捷,結(jié)果也更加可靠,可以實(shí)現(xiàn)包括單倍型分析、遺傳連鎖分析或構(gòu)建遺傳連鎖圖譜等在內(nèi)的多種應(yīng)用。
檢測內(nèi)容
編號 | 服務(wù)名稱 | 內(nèi)容說明 | 周 期 |
MG301 | 微衛(wèi)星 單色檢測 | 單色檢測,數(shù)據(jù)分析size等 | 5工作日 |
MG302 | 微衛(wèi)星 多單色檢測 | 多色檢測,數(shù)據(jù)分析size等 | 5工作日 |
MG303 | 微衛(wèi)星 AFLP跑板 | 上機(jī)檢測,數(shù)據(jù)分析01矩陣等 | 5工作日 |
MG304 | 微衛(wèi)星 STR跑板 | 上機(jī)檢測,不分析數(shù)據(jù)等 | 5工作日 |
MG305 | 微衛(wèi)星 普通引物合成 | 20D,PAGE純化,不超過30堿基 | 5工作日 |
MG306 | 微衛(wèi)星 熒光引物合成 | FAM 2OD HEX 20D TMR 2OD ROX 2OD | 7工作日 |
MG307 | 微衛(wèi)星 引物設(shè)計(jì) | 不含驗(yàn)證 | 3工作日 |
檢測流程
技術(shù)優(yōu)勢
1. 開發(fā)SSR多態(tài)性引物
針對基因組序列信息未知或不完整的物種,開發(fā)出多態(tài)性比較好的SSR引物。
1) 序列已知:根據(jù)數(shù)據(jù)庫發(fā)布的全基因組序列或EST序列,得到微衛(wèi)星序列信息。
2) 序列未知:采用磁珠富集的方法,對微衛(wèi)星序列進(jìn)行富集、克隆、測序,得到微衛(wèi)星序列信息。
2. 大量群體樣本微衛(wèi)星分析
針對已開發(fā)出的多態(tài)性SSR位點(diǎn),對大量群體樣本進(jìn)行微衛(wèi)星分析,得到個體的基因型。
3. 根據(jù)個體的基因型進(jìn)行連鎖分析
1) 遺傳連鎖圖譜。
2) 連鎖不平衡分析。
3) LOH分析。
檢測結(jié)果示例
我們的優(yōu)勢
1、提供各種實(shí)驗(yàn)材料和儀器,滿足項(xiàng)目課題實(shí)驗(yàn)需要。
2、專業(yè)的操作人員。
3、高規(guī)格實(shí)驗(yàn)室。
4、數(shù)據(jù)結(jié)果交付周期快。
5、完善的服務(wù)體系,全程跟進(jìn),確保滿意。
服務(wù)流程
1、提交項(xiàng)目課題相關(guān)需求和資料。
2、與我們的專業(yè)技術(shù)團(tuán)隊(duì)討論項(xiàng)目細(xì)節(jié)。
3、根據(jù)討論后的意見對實(shí)驗(yàn)方案進(jìn)行修改。
4、雙方均滿意并達(dá)成一致,簽訂技術(shù)服務(wù)合同。
5、開展實(shí)驗(yàn),按期完成合同規(guī)定的內(nèi)容。
6、結(jié)題,提供實(shí)驗(yàn)原始結(jié)果和分析結(jié)果、實(shí)驗(yàn)流程、實(shí)驗(yàn)條件等等。
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