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捕獲探針試劑盒定制服務(wù)

 更新時(shí)間:2019-02-20 點(diǎn)擊量:1883

 

 

探針捕獲測(cè)序是常用的目標(biāo)區(qū)域基因檢測(cè)方案,該方案基于多因素算法對(duì)目標(biāo)區(qū)域基因組進(jìn)行設(shè)計(jì),然后合成出有效的特異性探針, 進(jìn)而與基因組DNA進(jìn)行雜交,將目標(biāo)區(qū)域序列進(jìn)行捕獲并富集后,使用主流的illumina測(cè)序平臺(tái)進(jìn)行高通量測(cè)序。 通過(guò)對(duì)大量樣本的目標(biāo)區(qū)域研究,有助于發(fā)現(xiàn)和驗(yàn)證疾病相關(guān)的目標(biāo)基因和關(guān)鍵位點(diǎn),在臨床診斷和藥物開(kāi)發(fā)方面有著巨大的應(yīng)用空間, 同時(shí)在農(nóng)業(yè)領(lǐng)域相關(guān)研究中也有巨大的應(yīng)用潛力。

液相捕獲

操作簡(jiǎn)單,對(duì)儀器設(shè)備要求低,可在幾個(gè)小時(shí)內(nèi)完成目標(biāo)序列富集和測(cè)序文庫(kù)構(gòu)建,特別適用于臨床檢測(cè)。

固相捕獲

捕獲探針定制化流程

捕獲探針性能指標(biāo)

Sample

Aligned(%)

Initial bases on target

Coverage of target region

Fraction of effective bases on target

Average sequencing depth on target

Fraction of target covered with at least 10X

Fraction of target covered with at least 20X

1

98.8

483292

100.00%

40.10%

237.32

100.00%

99.80%

2

99.4

483292

100.00%

40.10%

219.48

100.00%

99.70%

3

98.81

483292

100.00%

40.10%

202.02

99.99%

99.70%

4

98.85

483292

100.00%

40.10%

237.56

99.99%

99.70%

5

98.4

483292

100.00%

40.10%

230.67

99.99%

99.70%

送檢樣本要求

樣品類型

樣品規(guī)格

樣品采集/運(yùn)輸

DNA(新鮮/冰凍樣品)

>1.0μg,濃度>20ng/μl

干冰運(yùn)輸

血液(全血)

>1ml

EDTA抗凝,2-8 °C冷藏運(yùn)輸

新鮮組織

>500mg

低于-20 °C(干冰)冷凍運(yùn)輸

唾液

>1ml

唾液保存液混合可室溫運(yùn)輸,直接收集唾液需冷凍運(yùn)輸

ctDNA

>1ml

要求血漿,干冰運(yùn)輸

FFPE

>1.5μ,濃度>20ng/μl

干冰運(yùn)輸

細(xì)胞

>8×106

去除培養(yǎng)液,PBS清洗1次后液氮速凍,干冰運(yùn)輸

石蠟切片

>5

10×10mm面積,常溫運(yùn)輸,穿刺組織>10片

石蠟包埋塊

>1

不小于1×1×1mm常溫運(yùn)輸

單細(xì)胞

>8×106

液氮速凍,干冰運(yùn)輸

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